La Cruz Verde Hondureña inició sus operaciones en Honduras en la ciudad de San Pedro Sula y seguidamente en Cedros, departamento de Francisco Morazán, además de las bases activas a nivel nacional. En la actualidad la Cruz Verde Hondureña tiene:
base central en la ciudad de Tegucigalpa
también tiene filiales en:
Choluteca,
Orica,
Guaimaca,
Sambo Creek
y Potrerillos.
Existen dos cargos relevantes a nivel nacional:
Dirección de la Unidad de Gestión de Riesgo para la Preparación y Respuesta a Desastres, ayuda y asistencia humanitaria.
Dirección Nacional de la Escuela de Capacitación Técnica (ESCAT).
